地球物理學(xué)家田所雄介博士（小林桂樹(shù) 飾）帶領(lǐng)自己的團(tuán)隊(duì)前往深海科考，卻發(fā)現(xiàn)海底出現(xiàn)異常龜裂與亂泥流，在一系列調(diào)查之后，他得出來(lái)日本列島在一年后即將沉沒(méi)的結(jié)論。可是日本政府的官員們卻認(rèn)為田所博士的預(yù)測(cè)只不值得相信的謊言。只有山本首相（石坂浩二 飾）認(rèn)識(shí)到事態(tài)的嚴(yán)重性，并且委任田所的前妻鷹森沙織（大地真央 飾）為危機(jī)管理大臣，帶領(lǐng)田所博士和他們的團(tuán)隊(duì)設(shè)法拯救日本。很快，從北海道開(kāi)始，日本諸島先生發(fā)生大規(guī)模的地質(zhì)災(zāi)害，整個(gè)日本陷入一片恐慌。政府對(duì)于災(zāi)害束手無(wú)措，僅有的海外移居政策完全不能應(yīng)對(duì)急劇惡化的態(tài)勢(shì)，日本諸島完全沉沒(méi)的現(xiàn)實(shí)即將上演。最終，田中博士和自己的科考隊(duì)員們終于找到一個(gè)可以挽救日本的方法，但這個(gè)方法的實(shí)際操作卻困難重重……